Zetasizer APS를 사용한 웰 플레이트 데이터의 신속한 선별

서론

Zetasizer 자동 플레이트 샘플러(APS)는 동적 광 산란(DLS) 장비로서 작업자가 개입할 필요없이 측정 과정을 자동화하고 다수의 샘플 측정을 가능하게 합니다.

자동화를 통해 대량의 데이터를 생성할 수 있으며 이로 인해 올바른 데이터 처리의 중요성이 높아집니다. 데이터 표시 기능은 작업자가 모든 측정값을 수동으로 스캔할 필요없이 관심있는 결과를 쉽게 검색할 수 있도록 합니다.

새로운 Zetasizer APS에는 플레이트 탐색기라고 하는 새로운 기능이 소프트웨어에 추가되었습니다. 이 기능은 가장 관심있는 정보의 검색 결과를 빠르게 선별한 다음 데이터에 대한 세부 검토를 가능하게 하는 데이터 매핑 도구를 포함합니다.

이 응용 노트에서는 플레이트 탐색기의 기능을 강조해서 설명하고 샘플 분석에 어떻게 사용할 수 있는지를 보여줍니다.

플레이트 탐색기

그림 1에는 플레이트 탐색기라고 하는 보기에 Zetasizer APS 결과가 요약되어 있습니다. 이는 플레이트 및 결과에 대해 그래픽으로 표시된 개요입니다. 그림 1에서는 선별 매개 변수가 선택되지 않았습니다. 이 경우 서로 다른 표준 작동 절차(SOPs)가 사용된 곳은 서로 다른 색상으로 표시되었습니다. 마우스를 원하는 웰 위로 가져가면 개별 웰과 관련된 데이터에 대한 빠른 검토가 표시됩니다.

그림 1: 4가지의 다른 색상 영역으로 표시된 4가지 서로 다른 SOP가 사용되는 플레이트를 보여주는 플레이트 탐색기의 예

결과 선별

플레이트 탐색기는 또한 사용 가능한 사용자 지정 매개 변수 범위 중 하나에 기초한 결과를 빠르게 선별할 수 있도록 해 줍니다.

선별 매개 변수 선택

선별 매개 변수는 플레이트 탐색기의 왼쪽 부분에서 선택할 수 있습니다. 그림 2에서 선택한 선별 매개 변수는 Z-평균 반경입니다. 데이터는 2가지 색상간 구배로 표시되었고 전체 구배는 플레이트 탐색기의 아래 부분에 한계 값과 함께 표시되었습니다. 선별 매개 변수의 상한 및 하한값은 사용자가 설정합니다. 한계 값에 사용되는 색상은 사용자가 지정할 수 있습니다.

그림 2: 선별 매개 변수로 Z-평균 반경을 선택한 경우에 대한 플레이트 탐색기의 예 Z-평균 반경의 하한 및 상한값은 0.1~5nm로 선택하였습니다.

디스플레이 옵션

디스플레이 옵션에서 사용자는 선택한 선별 매개 변수에 대해 각 웰에 수치 라벨을 표시할지 여부를 정의할 수 있습니다. 또한 매개 변수에 대한 단위도 정의할 수 있으며, 예를 들어 Z-평균의 경우 나노미터 단위의 직경 또는 반경 중에서 값을 표시하도록 선택할 수 있습니다.

왼쪽 아래에는 선별된 웰의 번호가 표시되어 있습니다. 그림 2에 나와 있는 예에서는 25개의 웰이 선별되었습니다.

추가적인 데이터 탐색

기록 보기와의 연결

플레이트가 측정되면 결과가 기록 보기 및 플레이트 탐색기에 표시되며 기록 보기의 각 행은 하나의 웰에서 나온 하나의 측정값에 해당합니다. 이를 통해 사용자는 플레이트 탐색기에서 그림 3에 파란색 원형 링으로 표시된 특정 웰을 선택할 수 있습니다. 이에 따라 해당 측정값에 대한 측정 기록이 기록 보기에서 강조 표시되며 사용자는 이 결과를 더 자세히 검토할 수 있습니다.

그림 3: 플레이트 탐색기에서 선택한 웰이 기록 보기에서 강조 표시되어 나타납니다.

관심 데이터의 중첩

플레이트 탐색기에서 사용자는 선택한 웰에서 나온 결과를 다양한 보고서에 중첩할 수 있습니다. 그림 4에 이에 대한 예가 나와 있으며 여기서는 각각 다른 2개의 웰에 있는 샘플에 대해 3회 반복 측정한 값에 대한 강도 분포를 보여줍니다.

그림 4: 각각 다른 웰에서 나온 결과는 소프트웨어에서 제공되는 각각 다른 보고서에 비교를 위해 중첩할 수 있습니다.

플레이트 보고서

플레이트 보고서용 데이터 선택

Zetasizer 소프트웨어는 APS 데이터에 대한 추가적인 보고서를 제공하며 여기에서 플레이트 결과의 그래픽 표시를 인쇄할 수 있습니다. 사용자는 플레이트 탐색기를 사용하여 플레이트 보고서에 표시할 웰을 선택합니다. 그림 5에서는 Z-평균 반경을 기준으로 플레이트가 선별되었고 상한은 5nm, 하한은 0.1nm입니다. 플레이트 그래픽의 왼쪽 위에 있는 원형 표시를 눌러 이들 선별 값(어두운 파란색 원으로 강조 표시됨)의 범위에 포함되는 모든 웰을 선택하였습니다. 이어서 이들 웰은 사용자가 유사한 값을 가진 샘플을 더 쉽게 식별하도록 해 주는 색상 구배와 함께 플레이트 보고서에 표시됩니다.

그림 5: 플레이트 탐색기를 사용하여 사용자는 획득한 결과를 선별 및 선택하여 플레이트 보고서에 관심 데이터에 대한 플롯을 생성하고 문서로 인쇄할 수 있습니다.

플레이트 보고서에서 디스플레이 매개 변수 선택

표 보고서에 표시할 매개 변수를 선택하려면 플레이트 매개 변수를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭합니다. 그림 6에서는 어떻게 매개 변수를 Z-평균에서 유도 계수비(Derived Count Rate)(예를 들어, 팝업 창 : 플레이트 모사 특성)로 변경하는지를 보여주며 이어서 사용자는 선택 버튼을 눌러 표시할 매개 변수(이 경우는 유도 계수비)를 선택할 수 있습니다.

그림 6: 플레이트 보고서에 표시되는 매개 변수는 보고서의 매개 변수 이름을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하여 사용 가능한 매개 변수 중 어떤 것으로든 변경할 수 있습니다.

요약

Zetasizer APS 소프트웨어의 플레이트 탐색기 도구를 통해 대용량의 데이터를 쉽고 빠르게 처리할 수 있습니다. 이 응용 노트에서는 사용 가능한 서로 다른 기능 및 이들 기능이 어떻게 데이터를 선별하고 결과를 자세히 검토할 수 있도록 해 주는지에 대해 설명하였습니다.

단백질 작업 영역인 플레이트 보고서에 새로운 보고서 페이지가 있으며 여기에서 기록 보관용으로 플레이트의 그래픽 출력을 인쇄할 수 있습니다.