EasySAXS 2.2

Software avanzado de análisis de datos SAXS

EasySAXS es un paquete de software avanzado, fácil de usar, para el análisis de datos de dispersión de rayos X de ángulo pequeño (SAXS). Proporciona información sobre las dimensiones y estructuras de nanoescala, las formas de nanopartículas y las áreas de superficie. El software también admite el análisis de datos de dispersión de rayos X de ángulo ultrapequeño (USAXS).

EasySAXS ofrece una caja de herramientas de análisis de datos integral, opciones de automatización e informes. La interfaz de usuario permite un cómodo acceso a todas las funcionalidades y configuraciones de los parámetros. Estas incluyen la reducción de datos, los análisis Guinier y Porod, la determinación de la distribución del tamaño de partículas y poros, el cálculo de la función p(r) de distribución de distancia de par, el ajuste de mínimos cuadrados y simulaciones de modelos.

EasySAXS se entrega con una Guía de inicio rápido, una función de Ayuda detallada con instrucciones paso a paso y datos de ejemplo para ejercicios. Es ideal tanto para expertos en SAXS como para principiantes.

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Características

Facilidad de uso

La interfaz gráfica de usuario de EasySAXS brinda un acceso especialmente sencillo y eficaz a todas las funciones del software y la configuración de parámetros. Los datos experimentales de SAXS y los resultados del análisis se muestran en dos paneles gráficos. 

Los datos se pueden mostrar de varias formas, por ejemplo, utilizando escalas lin/log o log/log, o en un diagrama de Guinier, Porod o Kratky. Un panel de mensajes informa sobre el progreso de los cálculos y muestra sugerencias y advertencias, cuando es necesario.

Todos los pasos del análisis de datos, incluidos todos los detalles, se pueden almacenar en un archivo de proyecto. Esto le permite reanudar el análisis posteriormente o compartir su esquema de análisis con otros. Todos los datos se pueden exportar para un procesamiento más extenso o para visualizarlos con otro software, si lo desea.

Opciones de análisis de datos SAXS

El software EasySAXS contiene una completa caja de herramientas que es compatible con toda la cadena de análisis de datos SAXS.

  • Manejo de datos primarios, como sustracción de fondo y desajuste
  • Radio de giro por análisis de Guinier
  • Distribución del tamaño de nanopartículas
  • Forma de partículas por análisis de función de distribución de pares
  • Área de superficie por análisis de Porod
  • Invariante de dispersión y volumen de Porod
  • Ajuste de modelos y simulaciones para diversas formas y estructuras de partículas
  • Análisis de datos USAXS

Los parámetros de análisis se pueden configurar cómodamente en el Panel de inspección de objetos del software.

Los datos se pueden exportar para un análisis más detallado con paquetes de software SAXS disponibles públicamente como ATSAS, Irena y SASfit.

Automatización e informes 

Los principiantes y los usuarios menos experimentados pueden comenzar rápidamente utilizando el modo automático de EasySAXS. Permite el análisis automatizado de la distribución del tamaño de partículas y poros de varios archivos de datos mediante la aplicación de plantillas de análisis que contienen configuraciones de parámetros predefinidos. Luego los resultados se resumen en informes de análisis personalizables y se exportan como archivos ASCII.

Con EasySAXS se suministra una gran variedad de plantillas de análisis, aplicables a diferentes tipos de muestras. Los usuarios también pueden crear sus propias plantillas para muestras específicas de interés.

Sistema de Ayuda 

EasySAXS contiene un completo sistema de Ayuda sensible al contexto. Incluye instrucciones paso a paso para todas las tareas, descripciones de parámetros, información teórica de fondo, referencias a la literatura científica, así como algunos ejemplos resueltos. Una Guía de inicio rápido adicional lo ayuda a explorar el concepto de uso del software en los modos automático e interactivo.

Una colaboración con científicos de clase mundial en el EMBL 

Algunos de los algoritmos utilizados en EasySAXS se basan en códigos del conocido conjunto de software ATSAS desarrollado por el Dr. Dmitri Svergun y su equipo en el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL, European Molecular Biology Laboratory) en Hamburgo, Alemania. Entre ellos se incluyen la función de distribución de distancias de pares y los análisis de distribución del tamaño de partículas habilitados mediante cálculos indirectos de transformación de Fourier. 

ATSAS es un popular conjunto de programas para análisis de datos de dispersión de ángulo pequeño a partir de macromoléculas biológicas. Los datos experimentales de SAXS adquiridos con ScatterX78 a partir de soluciones de proteínas diluidas se pueden preprocesar con EasySAXS y luego, exportarse a ATSAS para un análisis más exhaustivo, por ejemplo, la reconstrucción de la forma de la proteína desde el principio.

Especificaciones

El paquete total

El paquete EasySAXS incluye una Guía de inicio rápido y una función de Ayuda electrónica detallada. También contiene plantillas de análisis para el procesamiento automático por lotes de datos experimentales y archivos de ejemplo para realizar ejercicios. EasySAXS se ejecuta en Windows 7, Windows 8.1 (64 bits) y Windows 10 (64 bits). 

Versión actual: 2.2