Approches analytiques in vitro pour étudier les interactions ligand-récepteur des plantes

Cet examen a pour but de fournir une vue d'ensemble des essais de liaison de ligands in vitro de pointe pour étudier les interactions récepteur-ligand. En plus d'introduire des principes de méthode et de nouveaux développements, nous mettons en évidence les avantages et les limites (résumés dans les tableaux 1 à 3), et formulons des recommandations dans le but que les lecteurs puissent utiliser ces informations comme référence lors du choix de la ou des techniques d'interaction protéine/récepteur-ligand les plus appropriées pour étudier leur système. À titre de référence, nous avons également inclus un certain nombre d'exemples d'interactions ligand-récepteur de plantes caractérisées par différentes méthodologies.

Chez les plantes, les interactions récepteur-ligand régissent et surveillent un grand nombre de processus physiologiques, y compris la croissance, le développement des plantes, l'immunité et les interactions avec l'environnement, entre autres réponses biologiques. En détectant les ligands et en s'y liant, les récepteurs activent ou inhibent les voies de signalisation biochimique pour réguler les processus cellulaires (Lumba et coll., 2010 ; Couto et Zipfel, 2016 ; Hohmann et coll., 2017, 2018a ; Moussu et Santiago, 2019). 

L'identification des acteurs clés et la caractérisation de leurs interactions biochimiques sont fondamentales pour comprendre les mécanismes moléculaires qui régulent ces processus. La quantification des différents paramètres entraînant la formation de complexes de signalisation est un aspect essentiel de la décomposition des mécanismes biochimiques sur lesquels s'appuie la communication cellulaire est (Du et coll., 2016). De nos jours, il existe différentes techniques disponibles pour quantifier les interactions biomoléculaires qui fournissent l'affinité de liaison (la force de l'interaction entre deux molécules), la cinétique (la rapidité de l'interaction) et la spécificité de ligand (la spécificité de l'interaction entre deux molécules). 

Cet examen a pour but de fournir une vue d'ensemble des essais de liaison de ligands in vitro de pointe pour étudier les interactions récepteur-ligand. Un examen approfondi des méthodes d'analyse des interactions protéine-protéine in vivo a récemment été publié par Xing et coll. (2016). En plus d'introduire des principes de méthode et de nouveaux développements, nous soulignons les avantages et les limites et nous formulons des recommandations dans le but que les lecteurs puissent utiliser ces informations comme référence lors du choix de la ou des techniques d'interaction protéine/récepteur-ligand les plus appropriées pour étudier leur système. À titre de référence, nous avons également inclus un certain nombre d'exemples d'interactions ligand-récepteur de plantes caractérisées par différentes méthodologies.

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