FAQ : Estimation du poids moléculaire à partir de DLS ?

par Ulf Nobbmann, Tuesday, 16th September 2014

Voici une question que j’ai récemment rencontrée et qui, selon moi, pourrait valoir la peine d’être postée ici :

« Je voudrais utiliser les données de taille de particule pour calculer une estimation du poids moléculaire. Pourriez-vous me fournir des informations à ce sujet ? Par exemple, dois-je utiliser la taille moyenne par nombre ou par volume ou par intensité ? »

Si vous souhaitez utiliser les données de taille pour prédire/estimer le poids moléculaire, je vous recommande d’utiliser la taille de la distribution en intensité. Cependant, si vous avez un pic large, l’utilisation de la distribution en volume peut également fournir des informations utiles. Très souvent, s’il y a une distribution de plusieurs espèces différentes, le poids moléculaire estimé à partir de la distribution en volume vous donnera une idée de la plus petite partie de la distribution. Par exemple, pour les protéines, s’il y a un équilibre monomère-dimère, l’estimation à partir de l’intensité donnera un poids moléculaire moyen quelque part entre les deux, mais en utilisant l’estimation à partir du volume, cela sera très proche du poids moléculaire du monomère.

Capture d'écran de calculateur d'estimation de poids moléculaire dans le logiciel Zetasizer

 Vous pouvez ensuite insérer ces chiffres dans l’estimateur de poids moléculaire du logiciel Zetasizer sous Outils → Calculatrices → onglet Estimations MW & Forme pour obtenir le poids moléculaire, par exemple pour le rayon de 8 nm. Dans la capture d’écran, le calculateur est affiché pour un rayon de 8 nm. Ici, l’estimation pour le poids moléculaire d’une molécule semblable à un polysaccharide linéaire serait attendue à 88 kDa. Si la molécule était attendue pour être plus semblable à un polysaccharide ramifié, le 8 nm correspondrait à une estimation de 207 kDa. Ceci est une estimation, et généralement, celle-ci est bonne à ~20 % près, cependant, il peut y avoir des cas de déviations plus importantes pour d’autres formes moléculaires.

La note technique intitulée ‘Introduction aux calculateurs dans le logiciel Zetasizer‘ montre une partie du contexte et des références derrière les divers calculateurs disponibles dans le logiciel, un résumé des informations est également disponible dans le résumé intitulé « FAQ Peut-on mesurer le MW avec DLS? »

Les unités pour le poids moléculaire (ou plus correctement : la masse molaire) dans le calculateur sont le kilo Dalton [kDa], ce qui est équivalent à kg/mol. 1 kDa est équivalent à 1000 Da ou 1000 g/mol.

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