最佳實踐:蛋白質及生物聚合物的差示掃描量熱法
在之前的博客文章中,我討論了如何利用MicroCal DSC獲得高質量數據的最佳實踐。以下是關於MicroCal PEAQ-DSC系統以及MicroCal VP-Capillary DSC和VP-DSC系統的更多最佳實踐。這些最佳實踐適用於溶液中蛋白質和其他生物聚合物的分析。
樣品要求:
- 為了獲得高質量的差示掃描量熱法(DSC)數據,樣品需放在所需的緩衝液中(pH、鹽、賦形劑等),並在DSC參考池中使用匹配的緩衝液進行緩衝液-緩衝液掃描。
- 通過透析、去鹽柱或其他緩衝液交換方法準備樣品。
- 保存透析/緩衝液交換所得的緩衝液,用於參考池、緩衝液-緩衝液掃描及樣品稀釋。
- 推薦的蛋白質濃度範圍為0.1 mg/ml到2 mg/ml。
- DSC所得的Tm可能與濃度相關。
- 對於Tm篩選和可比性/相似性研究,確保所有蛋白質濃度相匹配。
DSC設定:
- 在使用DSC進行Tm篩選和可比性/相似性研究時,確保所有設置相同,包括掃描速率、溫度範圍、反饋模式、預掃描恆溫。
- Tm和DSC熱圖可能依賴於掃描速率和反饋模式。
- 溫度範圍:掃描開始於第1 st Tm以下10-20°C,結束於最終Tm以上10-20°C。
- 掃描速率:
- 蛋白質和核酸的一般掃描速率為60到90°C/h
- 脂質的一般掃描速率為30到60°C/h
- 對於MicroCal PEAQ-DSC和VP-Capillary DSC,使用180到240°C/h的掃描速率以增加Tm篩選的樣品通量
- 推薦的“反饋模式”:
- 蛋白質—無或低
- DNA和RNA—低或中
- 脂質—高
- 推薦的“預掃描恆溫”時間為3到15分鐘。
對於自動化MicroCal PEAQ-DSC和VP-Capillary DSC系統:
- 確保樣品在DSC分析前儲存在適當的溫度下。對於蛋白質和其他生物分子,將冷卻架溫度設為5到10°C。如果您研究的是熱穩定材料,可以將冷卻架溫度設為25°C。
- 使用至少三次的滲透補充(在VP-Capillary DSC中稱為“填充劑次數”)從96孔板對DSC池進行填充。
- 使用20% Contrad 70或14% Decon 90進行池清洗編程。
DSC原始數據質量:
- 總是進行匹配的緩衝液-緩衝液掃描(在相同的掃描條件下進行),用以數據分析。如果需要,可以在每次樣品前進行一次緩衝液-緩衝液掃描。
- 頻繁的緩衝液-緩衝液掃描是額外的儀器性能檢查,以確保DSC池乾淨,儀器運作正常。
- 緩衝液-緩衝液掃描應在整個序列中具有可再現性(假設相同的DSC運行參數)。
- 使用自動化PEAQ-DSC及其高效的清洗泵和優化的DSC池清洗協議,可以連續進行三個(或更多)樣品的運行,而無需中間進行緩衝液-緩衝液掃描。
- 原始DSC熱圖的DP值(以mcal/min為單位)在開始緩衝液-緩衝液或水水掃描時應接近零。
- 在蛋白質掃描開始時,DP值通常會相比於匹配的緩衝液-緩衝液掃描更為負。更高的蛋白質濃度會有更大的負向偏移。在良好的緩衝液匹配下,每1 g/L的蛋白質,這種DP差異應約為0.15到0.25 mcal/min(圖1)。
- 如果蛋白質與緩衝液-緩衝液掃描之間的DP差異大於1 mcal/min,這可能是由於蛋白質和緩衝液之間的緩衝液不匹配、池不乾淨、池未填滿、池中有氣泡或蛋白質濃度過高(圖2)。
圖1。
圖2。
觀看此視頻解釋什麼是差示掃描量熱法
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