A customer perspective on hit validation in fragment based drug discovery
Seminario web grabado
Introducción
El sistema MicroCal PEAQ-ITC automatizado combina la alta sensibilidad del MicroCal PEAQ-ITC, el núcleo calorímetro del sistema, con la automatización sencilla, para satisfacer las necesidades de productividad de los ocupados laboratorios de investigación y descubrimiento de fármacos.
El sistema mide directamente el calor que se libera o se absorbe durante los eventos de enlace bioquímico, del que se calcula la afinidad de enlace (KD), la estequiometría (n), la entalpía (ΔH) y la entropía (ΔS).
Además de preparar muestras y reactivos para las concentraciones adecuadas, hay un mínimo desarrollo del ensayo y tiempo hasta el primer resultado. El software fácil de usar incluye scripts de automatización optimizados que permiten un excelente funcionamiento en una gran variedad de condiciones y tipos de muestras.
Características y beneficios
- Herramientas de diseño sencillas para la selección de parámetros de ejecución experimentales.
- Todos los parámetros de enlace (afinidad, estequiometría, entalpía y entropía) en un solo experimento.
- Rápido para dar el primer resultado con un desarrollo de ensayo mínimo, libre de marcadores, sin inmovilización y sin limitaciones de peso molecular.
- La alta señal al ruido le da más confianza para acceder a los datos de calidad y relevancia de los parámetros termodinámicos y de afinidad generada.
- Extraordinaria calidad de datos para brindar la constante de disociación de sub-milimolar hasta picomolar (10-2 to 10-12 M).
- Las celdas con forma de moneda optimizan la mezcla de las muestras.
- Hastelloy no reactivo para la resistencia y compatibilidad química con las muestras biológicas.
- Sensibilidad para investigar cualquier interacción biomolecular usando tan solo 10 μg de proteína.
- Las muestras se presentan en placas de 96 pozos a una temperatura controlada.
- Sistema totalmente automatizado con un funcionamiento sencillo para mejorar la productividad.
Cómo funciona
Los microcalorímetros de titulación isotérmica miden el cambio de calor que se produce cuando interactúan dos moléculas. El calor se libera o absorbe como resultado de la redistribución y formación de enlaces no covalentes cuando las moléculas que interactúan pasan de estado libre a enlazadas. El ITC supervisa estos cambios de calor mediante la medición del diferencial de potencia que se aplica a los calentadores de celdas, necesarios para mantener en cero la diferencia de temperatura entre la celda de referencia y la celda de muestra cuando se mezclan los componentes de enlace. La celda de referencia por lo general contiene agua, mientras que la celda de muestra contiene uno de los componentes de enlace (la muestra, a menudo, pero no necesariamente una macromolécula) y una jeringa de agitación que contiene el otro componente de enlace (el ligando).
El ligando se inyecta en la celda de muestra, por lo general en pequeñas alícuotas de 0.5 a 2 μL, hasta que la concentración del ligando sea 2 o 3 veces mayor que la de la muestra.
Cada inyección de ligando da como resultado un pulso de calor que se integra con respecto al tiempo y se normaliza para la concentración para generar una curva de titulación de kcal/mol en comparación con la relación molar (ligando/muestra).
El isotermo resultante se ajusta a un modelo de enlace para generar afinidad (KD), estequiometría (n) y entalpía de interacción (ΔH).
Software de análisis
El software de análisis MicroCal PEAQ-ITC permite realizar una simulación de diseño experimental, la evaluación en lote de grandes conjuntos de datos, la evaluación automatizada de la calidad de datos y cuenta con una interfaz de usuario simplificada que lo guía a las cifras finales y a la presentación de gráficos de calidad de un modo rápido y sencillo.
- Permite abrir varios experimentos en una sola sesión
- Es compatible con muchos modelos de ajuste automático
- Disociación
- Cinética de la enzima - Múltiples inyecciones
- Cinética de la enzima - Una sola inyección
- Un conjunto de sitios
- Sitios de enlace secuenciales
- Un conjunto de sitios - SIM
- Dos conjuntos de sitios
- Competitivo
- Evaluación automatizada de la calidad de los datos
- Buena calidad de los datos - con enlace
- Buena calidad de los datos - sin enlace
- Mala calidad de datos - Comprobar datos
Very good instrument, fast and easy to use."
Clarissa Melo Czekster — University of St Andrews
